Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gja5Q01231 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gja5Q01231 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms