Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Grin2cQ01098 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Grin2cQ01098 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms