Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Grin2bQ01097 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Grin2bQ01097 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms