Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pde1bQ01065 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pde1bQ01065 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms