Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PrcdQ00LT2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PrcdQ00LT2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms