Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
VegfaQ00731 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VegfaQ00731 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.6 ms