Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Apoa1Q00623 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms