Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PgrQ00175 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PgrQ00175 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms