Protein–RNA interactions for Protein: P97946

Vegfd, Vascular endothelial growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfdP97946 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VegfdP97946 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VegfdP97946 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms