Protein–RNA interactions for Protein: P97496

Smarcc1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcc1P97496 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarcc1P97496 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarcc1P97496 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms