Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gbx1P82976 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gbx1P82976 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms