Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SgcdP82347 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SgcdP82347 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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