Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Irx1P81068 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Irx1P81068 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms