Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Irx3P81067 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms