Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ldb1P70662 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms