Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fgf11P70378 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fgf11P70378 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms