Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Stra8P70278 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Stra8P70278 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Stra8P70278 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Stra8P70278 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms