Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rad54lP70270 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rad54lP70270 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms