Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Traf6P70196 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Traf6P70196 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms