Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Copz1P61924 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Copz1P61924 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Copz1P61924 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms