Protein–RNA interactions for Protein: P61807

Snn, Stannin, mousemouse

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnnP61807 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SnnP61807 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SnnP61807 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SnnP61807 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SnnP61807 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SnnP61807 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms