Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psme3P61290 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psme3P61290 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme3P61290 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms