Protein–RNA interactions for Protein: P61028

Rab8b, Ras-related protein Rab-8B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8bP61028 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab8bP61028 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab8bP61028 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms