Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ActbP60710 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
ActbP60710 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
ActbP60710 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
ActbP60710 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
ActbP60710 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms