Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nphp4P59240 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nphp4P59240 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms