Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nup43P59235 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup43P59235 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms