Protein–RNA interactions for Protein: P58281

Opa1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa1P58281 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Opa1P58281 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opa1P58281 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms