Protein–RNA interactions for Protein: P57724

Pcbp4, Poly(rC)-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp4P57724 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Pcbp4P57724 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pcbp4P57724 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms