Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn18P56857 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn18P56857 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cldn18P56857 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms