Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lim2P56563 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Lim2P56563 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Lim2P56563 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms