Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp5P56399 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp5P56399 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp5P56399 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Usp5P56399 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms