Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NrlP54846 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrlP54846 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrlP54846 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NrlP54846 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NrlP54846 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NrlP54846 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NrlP54846 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms