Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fdft1P53798 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fdft1P53798 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms