Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Defa8P50706 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms