Protein–RNA interactions for Protein: P50586

Tub, Tubby protein, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TubP50586 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TubP50586 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TubP50586 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TubP50586 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TubP50586 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TubP50586 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms