Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdhaP50136 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BckdhaP50136 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms