Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cav1P49817 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cav1P49817 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms