Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Wnt11P48615 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms