Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prox1P48437 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms