Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pax7P47239 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms