Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
VhlP40338 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VhlP40338 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VhlP40338 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
VhlP40338 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
VhlP40338 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
VhlP40338 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
VhlP40338 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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