Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col18a1P39061 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col18a1P39061 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms