Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sftpa1P35242 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sftpa1P35242 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms