Protein–RNA interactions for Protein: P34960

Mmp12, Macrophage metalloelastase, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp12P34960 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp12P34960 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms