Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Apoc3P33622 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Apoc3P33622 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms