Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nedd1P33215 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd1P33215 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms