Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Hoxa2P31245 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Hoxa2P31245 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms