Protein–RNA interactions for Protein: P29595

Nedd8, NEDD8, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd8P29595 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nedd8P29595 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nedd8P29595 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms