Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp1P29452 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp1P29452 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp1P29452 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms