Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pabpc1P29341 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms